- _ -

• _sort_tracker_type : mems

- a -

• AbstractMatchSeqManipulator : mems
• aFILE : mems
• aIORec : mems

- b -

• backbone_list_t : mems
• bb_entry_t : mems
• bb_seqentry_t : mems
• bin_t : mems
• bitset_t : mems
• buffer_list_t : mems
• buffer_t : mems

- d -

• DenseAbstractMatch128 : mems
• DenseAbstractMatch16 : mems
• DenseAbstractMatch2 : mems
• DenseAbstractMatch32 : mems
• DenseAbstractMatch4 : mems
• DenseAbstractMatch64 : mems
• DenseAbstractMatch8 : mems
• device_t : mems
• dmtimer_t : mems

- h -

• hss_array_t : mems
• hss_list_t : mems

- i -

• IdmerList : mems
• Interval : mems
• IntervalList : mems
• iodevice_t : mems
• IslandCols : mems
• iv_tracker_t : mems

- m -

• mask_t : mems
• Match : mems
• MatchID_t : mems
• MatchList : mems

- n -

• neighbor_t : mems

- o -

• offset_t : mems

- p -

• pairwise_genome_hss_t : mems
• PairwiseLCBMatrix : mems
• position_t : mems

- r -

• record_t : mems

- s -

• sarID_t : mems
• score_t : mems
• search_cache_t : mems
• seqbuf_t : mems
• sml_t : mems
• SMLHeader_t : mems
• smlSeqI_t : mems
• sort_buf_t : mems

- t -

• TrackingMatch : mems

- u -

• uint32 : mems
• uint64 : mems
• uint8 : mems
• ULA : mems

- w -

• working_set_t : mems

---