• _USE_SLOT_ALLOCATOR : AbstractMatch.h
• DEFAULT_MEMORY_MINIMUM : FileSML.h
• DESCRIPTION_SIZE : SortedMerList.h
• DNA_ALPHA_BITS : SortedMerList.h
• DNA_MER_SIZE : SortedMerList.h
• LOWER_MASK : twister.c
• M : twister.c
• MATRIX_A : twister.c
• MER_REPEAT_LIMIT : MatchFinder.cpp
• MISALIGNMENT_WORKAROUND : ClustalInterface.cpp
• N : twister.c
• NO_UNIQUE_COUNT : SortedMerList.h
• OPT_ALPHA_MASQ : SortedMerList.cpp
• OPT_HEADER_ALPHABET_BITS : SortedMerList.cpp
• PROTEIN_ALPHA_BITS : SortedMerList.h
• PROTEIN_MER_SIZE : SortedMerList.h
• UPPER_MASK : twister.c

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